Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms