Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms