Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms