Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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