Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tnfrsf19Q9JLL3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Tnfrsf19Q9JLL3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms