Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Scamp5Q9JKD3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms