Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim39Q9ESN2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Trim39Q9ESN2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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