Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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