Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Smg9Q9DB90 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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