Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Usp12Q9D9M2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Usp12Q9D9M2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms