Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot8Q9D8X5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms