Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp4bQ9D8B3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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