Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sdr42e1Q9D665 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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