Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sohlh2Q9D489 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms