Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pramef12Q9D2F1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms