Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C1

Rnf115, E3 ubiquitin-protein ligase RNF115, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf115Q9D0C1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf115Q9D0C1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rnf115Q9D0C1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf115Q9D0C1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf115Q9D0C1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf115Q9D0C1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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