Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Shisa9Q9CZN4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms