Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrs1Q9CYH6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrs1Q9CYH6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms