Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbm8aQ9CWZ3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm8aQ9CWZ3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms