Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
NubplQ9CWD8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms