Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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