Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Q9CRC3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Q9CRC3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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