Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms