Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chmp3Q9CQ10 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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