Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nsmce3Q9CPR8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nsmce3Q9CPR8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms