Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rpl17Q9CPR4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rpl17Q9CPR4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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