Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms