Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Tdrd1Q99MV1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms