Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrrtQ99MR6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrrtQ99MR6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms