Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tm2d1Q99MB3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tm2d1Q99MB3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms