Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms