Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
EtfaQ99LC5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
EtfaQ99LC5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms