Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmed9Q99KF1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed9Q99KF1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms