Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd1bQ99JY6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms