Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pacsin3Q99JB8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pacsin3Q99JB8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pacsin3Q99JB8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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