Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms