Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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