Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek8Q91ZR4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms