Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fam20bQ8VCS3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms