Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms