Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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