Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pitrm1Q8K411 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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