Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r72Q8K3N7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r72Q8K3N7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms