Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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