Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ssh3Q8K330 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ssh3Q8K330 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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