Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gtf3c1Q8K284 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gtf3c1Q8K284 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms