Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrit1Q8K099 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrit1Q8K099 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms