Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LgsnQ8CIX8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LgsnQ8CIX8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms