Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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SbsnQ8CIT9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms