Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfcQ8CI19 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfcQ8CI19 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms